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AI/학부생 인턴 4

3. Resampling, RoI Crop

# Resampling 정상 케이스와 모야모야 케이스를 촬영하는 MR Protocol이 다르다는 점과 촬영 기기의 차이, 그리고 심지어 같은 스캐너를 사용했다고 하더라도 Voxel Spacing에 차이가 존재할 수 있다. 이를 1 : 1 : 1로 맞춰주기 위해 resampling을 진행하였다. resampling 코드나 방법은 검색하는대로 쉽게 찾아볼 수 있었다. # RoI Crop 학부 시험기간과 겹치고 교수님들께 피드백 받는 시간이 길어지는 동시에 가장 애를 먹였던 RoI Crop이다. 사람들마다 머리 모양이 모두 다르고, 머리를 차지하는 뇌의 크기도 다르다. 또한 앞서 언급하였던 스캔 프로토콜의 차이에 따라 이미지 속 뇌가 차지하는 면적이 모두 달랐기에 전체 이미지에서 RoI의 상대위치를 계산할 수..

AI/학부생 인턴 2022.05.09

2. Dicom to Nifti, Skull Stripping

모야모야병 확진 진단을 내리는 데 DSA 영상이 Gold Standard 역할을 하지만 Invasiveness 문제가 늘 뒤따랐다. 이에 3D TOF MRA 영상 데이터를 활용하여 모야모야병 환자와 정상 환자를 분류하는 Task를 해결한다. 간단해 보였다. 7월 중순에 프로젝트를 받아 7월 말부터 본격적으로 진행했는데 그때는 단순한 Binary Classification Task니까 ~ 생각했었다. 결론부터 말하자면 이제서야 Input Data가 만들어져 모델 구축 단계로 넘어갈 예정이다. 쉽지 않았다. 단독 프로젝트였으며, 3D MRA TOF Data를 세브란스 병원 PACS 에서 추출하는 과정부터 시작한 end-to-end 프로젝트였다. 데이터 전처리가 가장 중요하며, 모델은 그 다음 이야기라는 누군..

AI/학부생 인턴 2021.12.03
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